邱二娘生于清道光十三年（1833年），家里排行第二，其父邱柳，所以她叫邱二娘。童年因家中生活窘迫，被卖至刘家当童养媳，在刘家饱受丈夫及婆婆的非人般的虐待。性情刚烈的邱二娘实在无法忍受，流落到尼姑庵中，修得了一身好武艺，凭借这早年的医学知识和刺绣手艺，那几年的她便是她一生中最惬意的时光了。
朝廷的利税越来越苛刻，至使当地百姓无衣无食，在其表哥林怀的劝说下，孙二娘携“顺天命邱二娘”的旗号，提出“虽是女人乾坤造，邱氏召集贤众多，普天之下皆黄土，除清救民建帝都”的口号，揭竿而起。
此期间邱二娘所部，屡立战功。惩贪官污吏、分万亩土地，百姓衣食无忧，甚受百姓的拥戴。多次与太平天国所部呼应，给予封建统治者沉重的打击。
清军再也无法忽视这股军队，调重兵以围剿，重金悬赏邱二娘项上人头。起义队伍中陈大、陈桥、陈潮三人利益熏心,背叛邱二娘向朝廷告密，使得邱二娘被捕。他们领导贫苦农民抗捐抗税，袭击地主武装，惩办贪官污吏，队伍迅速扩大到几千人。起义后不久，林杯牺牲，邱二娘便以“顺天命邱娘娘”为旗帜，率领义军继续战斗。咸丰五年（1855年）五月，由于叛徒出卖，邱二娘被捕，随后被押解泉州。是年农历六月十四（7月27日），邱二娘被游街示众后，于泉州南校场被剥光衣服，凌迟处死，年仅22岁。
邱二娘牺牲后，惠安、泉州、仙游一带民众塑像奉祀，称之为“仙姑妈”、“游路夫人”、“庄脚妈”。后人编有《血染桐江》剧本颂扬其英雄事迹。 惠安县掌中木偶戏剧团也排出木偶戏《惠女英豪邱二娘》，鹭江出版社出版的历史小说《烈女哀鸿》，颂扬其英雄事迹。为了弘扬历史革命传统，宣传惠女精神，体现惠安雕艺文化，在邱二娘起义遗址一一半岭高明王宫前竖立邱二娘石雕塑像，再现了惠安历史上反抗封建压迫、追求自由平等的农民起义领袖的光辉形象。